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2013—2015年安庆地区腺病毒流行株型别鉴定及六邻体基因特征分析

Zhonghua weishengwuxue he mianyixue zazhi(2018)

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摘要
目的 了解引起安庆地区急性呼吸道感染的人类腺病毒( HAdv)流行株型别特点及编码六邻体蛋白基因及氨基酸残基的变异情况.方法 收集2013—2015年间流感监测哨点596份急性呼吸道感染患儿咽拭子,real-time PCR腺病毒核酸检测试剂盒进行检测,阳性标本进行Hep细胞病毒分离,对病毒分离成功样本进行六邻体蛋白基因( hexon gene) PCR扩增、测序并将序列与Gen-Bank发表的序列进行同源比对和进化树分析.结果 HAdv阳性标本68份,阳性率为11. 4% .病毒分离成功34株,其中,HAdv-3型为9株占26. 5% ;HAdv-7型为12株占35. 3% ;HAdv-14型为12株占35. 3% ;HAdv-55型为1株占2. 9% . 9株HAdv-3型分离株与KX384958亲缘关系最近,为99. 8% ~100% ,与其他株相比较氨基酸残基的变异主要有 3 个;12 株 HAdv-7 型分离株与 KX897164 和KU361344亲缘关系最近,为99. 8% ~100% ,与其他株相比较氨基酸残基的变异主要有7 个;12 株HAdv-14型分离株与JF420883亲缘关系最近,为99. 6% ~99. 9% ,与其他株相比较氨基酸残基的变异主要有3个;1株HAdv-55型分离株与KP279748和KX289874亲缘关系较近,核苷酸和氨基酸的同源性为100% .在这几个型别的研究株中HAdv-7 型变异最大,其次为 HAdv-14 型.结论 2013—2015年,引起安庆地区急性呼吸道感染的腺病毒流行株主要为HAdv-3型、HAdv-7型、HAdv-14型,同时存在少量HAdv-55型. HAdv-55型分离株六邻体基因稳定,没有出现变异.而HAdv-3型、HAdv-7型、HAdv-14型型别之间,核苷酸和氨基酸均发生不同程度的变异.在抗原决定簇HVR1、HVR2 和HVR7区存在氨基酸的变异.
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关键词
Acute respiratory infection,Adenovirus,Hexon
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