鳜胃蛋白酶基因外显子7上SNP检测及其与食性驯化相关分析

本研究旨在探寻胃蛋白酶(pepsinogen,PEP)基因的等位基因及其基因型在不同食性驯化表型鳜(Siniperca chuatsi)群体中的分布情况.通过2周食性驯化,挑选出最易驯化和最不易驯化的2组,提取各组鳜鳍条组织DNA,采用PCR产物直接测序法(direct sequencing,DS)、限制性片段长度多态性技术(restriction fragment length polymorphism,RFLP)和创造限制酶切位点PCR法(created restriction site PCR,CRS-PCR)对鳜胃蛋白酶基因5、6、7、8内含子和6、7、8外显子进行SNPs遗传多态性检测和分析.结果共检测到2个SNPs位点(ClT和C52T),均为同义突变,利用卡方检验分析,结果表明PEP基因的这2个SNPs位点分别与鳜的食性驯化不具显著相关性(P＞0.05).将2个SNPs位点的不同基因型组合成5种双倍型,卡方检验表明双倍型Dip1与Dip5在两组中存在显著差异(P＜0.05).本研究成功完成鳜PEP基因组多态性分析,因而可以考虑将PE基因作为影响鳜食性驯化的候选基因.