周学东长期从事口腔感染性疾病、口腔疾病与全身健康的基础和临床防治技术的研究。据2023年2月中国医学科学院网站显示，周学东已发表中英文论文253篇，位列Elsevier牙医学“中国高被引学者”；主编《中华口腔科学》《Qtlas of Oral Microbiology》《Denta Caries:Principles and Management》《华西口腔医院医疗诊疗与操作常规系列丛书》《口腔科常见及多发病就医指南系列丛书》等中英文专著和科普书17部。