研究成果：稻田生态系统甲烷氧化和氨氧化既可能相互促进，也可能相互抑制；农田管理措施导致稻田生态系统甲烷氧化细菌和氨氧化细菌的时空变异规律；首次发现非水生环境（土壤）存在T4噬菌体；在国际上首次证实氨氧化细菌，而非氨氧化古菌是农田土壤氨氧化过程的主要驱动者。

研究方向与重点：甲烷氧化和氨氧化的微生物生态学。

研究思路：碳氮是生命的基本元素，甲烷和氨分别是地球上最简单的碳氮化合物，因此，研究甲烷氧化和氨氧化的微生物生态机理，是从简单到复杂，深刻理解陆地生态系统碳氮循环过程的重要内容。此外，现有技术条件下，大约99%的地球微生物无法在实验室得到分离，因此被称为“难培养微生物”。近年来，难培养微生物被认为是地球上最丰富的生物资源之一，是生态系统碳氮循环过程的重要驱动者。因此，传统微生物和难培养微生物对生态系统碳氮循环的可能贡献率是目前微生物生态学的难点和热点。采用“稳定同位素核酸探针（DNA/RNA-SIP）”等先进技术，以氨氧化微生物为模式，我们将有望深入阐释这一问题。