目前已主持国家自然科学基金7项，主持上海市科委基础重点项目、上海市纳米专项基金、浙江省自然科学基金、浙江省科技厅重点项目、浙江省卫生厅等省级以上项目10项。2001获浙江省科学技术进步一等奖一项（第五完成人），2005获国家科技进步二等奖一项（第六完成人），2007年获中国高等学校科学技术进步奖一等奖一项（第二完成人），2016年获华夏医学科技奖一等奖一项（第一完成人），2017年获教育部科学技术进步奖一等奖一项（第一完成人），2017年获教育部高等学校自然科学奖一等奖（第一完成人），2017年获中华医学科技奖二等奖（第一完成人），2018年获第十九届吴阶平-保罗●杨森医学药学奖，2020年获上海市自然科学奖一等奖（第一完成人）。2014年全国五一劳动奖章获得者，2011年获上海交通大学优秀共产党员称号、上海市“五一”劳动奖章获得者，2012年获上海交通大学校长奖。