主要研究领域为医学人工智能，健康大数据分析，深度学习与自然语言处理。在人工智能和自然语言处理顶级会议 （ACL/COLING 等）发表论文10余篇，在医学重要期刊/会议如JAMA Network Open, AMIA等发表论文数篇。获ISTD最佳博士论文奖，第一作者论文获得COLING 最佳论文奖和ACL 最佳演示论文提名，被评为ACL 2018和COLING 2018 杰出审稿人。杨杰博士主导开发多款流行的自然语言处理开源工具，在GitHub上收藏量超过3500。