卢山教授自上世纪90年代初一直从事多种新型人类疫苗的基础研究，技术开发和临床人体试验，是核酸疫苗（DNA vaccine）的主要发明人之一，在世界上首次在人体内使用DNA联合蛋白质疫苗。近年来他开创了将核酸疫苗和传统亚单位疫苗结合的策略，建立了一种既能引导体液免疫又能激活细胞免疫的全新免疫方法。并首创用DNA免疫的方法，鉴定疫苗保护性抗原结构与功能的关系，并用此方法解决艾滋病，天花，SARS，流感等一系列重大传染病疫苗抗原的筛选和鉴定。为知名国际艾滋病疫苗专家，他主持研制的多价艾滋病疫苗获得美国FDA批准进行人体试验，是第一位将艾滋疫苗引入人体实验的华人科学家。卢山教授同时是国际生物保护疫苗和新发传染病疫苗的专家，在亚非发展中国家有广泛的合作。