Martin F. Bachmann machte sich einen Namen im Bereich therapeutischer Impfstoffe und Virus-artiger Partikel.

Während dieser Zeit wurde ein klinisches Proof-of-Concept im Menschen in mehreren Indikationen erreicht, unter anderem mit einem Impfstoff gegen Bluthochdruck, Rauchen, Allergie und Asthma. Ein von ihm entwickelter Impfstoff gegen die Alzheimer-Krankheit ist bei Novartis in einer Registrierungsstudie. Ab 2012 wandte sich Bachmann wieder der Akademie zu und fokussierte sich weiter auf therapeutische Impfstoffe, basierend auf Virus-artigen Partikeln. In Zusammenarbeit mit der Evax AG und der Hypopet AG wurde ein erfolgreiches Proof-of-Concept für therapeutische Impfstoffe gegen Insektenstichallergie beim Pferd und atopischer Dermatitis beim Hund erlangt. Weiter war es möglich, mittels einer Impfung Katzen hypoallergen zu machen, um das Zusammenleben mit allergischen Besitzern zu vereinfachen.