主要研究内容包括：
（1）病毒与天然免疫通路中重要蛋白的结构生物学研究。通过X射线晶体学解析了人体抗病毒天然免疫通路中重要激酶TBK1的类泛素结构域原子分辨率结构，讨论了这一结构组件对于 TBK1 及其它抗病毒蛋白的功能。参与A型流感病毒H5N1的RNA聚合酶复合体的结构研究，利用冷冻电镜解析了其近原子分辨率水平（4.3 Å）的结构，揭示其在不同生理活性下的多元状态，推动了对流感病毒的复制和繁殖机制的认识。

（2）真核生物DNA复制机理的研究。解析了人体DNA复制体的重要链接分子AND-1的晶体结构，揭示了人源DNA复制体不同于酵母的装配机制。