Jacques Balthazart est l'auteur de plus de 450 articles et revues scientifiques qui ont été cités plus de 23.000 fois. Il a en outre créé en 1983, à l'échelle européenne, un cycle de conférences sur le thème Hormones, cerveau et comportements, dont il a assuré la publication des comptes rendus. Il fut par ailleurs élu président, de 2003 à 2005, de la Society for Behavioral Neuroendocrinology. Il est membre du comité éditorial de plusieurs revues internationales et a été Co-editeur en Chef de la revue Frontiers in Neuroendocrinology de 2006 à 2016. Il est actuellement Editeur Associé de la revue Hormones and Behavior. Il a été élu en 2015 Fellow de l¿American Association for the Advancement of Science (AAAS), section Sciences Biologiques. Il a reçu en 2016 la « Donald Farner medal for distinguished work in Avian Neuroendocrinology » et en 2017 le Prix Daniel S. Lehrman de la Society for Behavioral Neuroendocrinology pour l¿ensemble de sa carrière.