Franz Daxecker (* 24. Mai 1945 in Munderfing) ist ein österreichischer Ophthalmologe und Wissenschaftshistoriker.
Seine ophthalmologischen Publikationen betreffen die Refraktionsbestimmung (Brillenbestimmung) mit dem Laser, die Berechnung von Intraokularlinsen, den Einfluss der Ultraviolettstrahlung auf das Auge sowie die Therapie der Augentumore.
Daxecker publizierte intensiv zum Astronomen Christoph Scheiner, aber auch zu Oswald von Wolkenstein, Christoph Grienberger, Johann Anton Scopoli, Felice Fontana, Pietro Andrea Mattioli, Ludwig Mauthner, Richard Seefelder, Dohrmann Kaspar Pischel, Kaspar Pischel, Friedrich von Herrenschwand, Burghard Breitner und Herbert Schober (1905–1975). Weitere Schriften betreffen Brillendarstellungen des Mittelalters, die Geschichte der Medizinischen Universität Innsbruck und Heilpflanzen des Mittelalters in der Augenheilkunde. Außerdem verfasst er Beiträge zu Lexika.