课题组主要利用ChIP-Seq、ATAC-Seq、HI-C等表观基因组测序手段，重点研究肠道微生物与宿主染色质修饰及基因转录调控间的相互作用，了解其对疾病的影响，寻找有效的干预靶标。研究结果发表在NatCommun、Genome Biol 等杂志。目前论文谷歌总引用达一千多次，H指数18；担任 Arch Toxicol 等多个杂志的特邀审稿人。