先后主持承担国家科技攻关、攀登计划、行业专项、转基因专项及省重大科技攻关等多个科研项目，并取得多项国家与省部级重大科技成果。

从事经济作物虫害防治研究。作物虫害研究室首席科学家，经作虫害防控方向负责人。

作为第1作者或通讯作者，柏立新研究员先后在Arch Insect Biochem Physiol，Pestic Biochem Physiol，Cell stress and chaperones，Insect science，Zootaxa， DNA mitchondrial、中国农业科学、植物生态学报、昆虫学报、棉花学报、防灾减灾工程学报等国内外核心期刊发表学术论文100余篇。主编著作1本《棉花病虫草害综合防治》(1992，江苏科技出版社)，另参编著作《中国棉花抗虫育种》(2002，江苏科技出版社)、《棉花生产百问百答》(2010，中国农业出版社)。主持制定江苏省地方标准5项。作为主持人或主要完成人先后获国家与省部级等科技成果奖7项，其中江苏省科技进步一等奖1项（排名第1）、二等奖1项（排名第1）、农业部科技进步一等奖1项（排名第4）、国家科技进步二等奖1项（排名第8）。

作为一线科技人员，经常深入基层与生产第一线，为乡村农技员与农民讲课，为农业丰产、农民增收作出了积极贡献。