基于网络药理学和分子对接探讨浙贝母-夏枯草药对治疗甲状腺结节的作用机制

目的:基于网络药理学探讨浙贝母-夏枯草治疗甲状腺结节(thyroid nodules)的作用机制.方法:在中药系统药理数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索浙贝母、夏枯草的化学成分,利用PharmMapper 数据库获取化学成分靶点,并采用Cytoscape 3.7.1 软件构建"药物-活性成分-靶点"网络.基于Genecards 数据库、在线人类孟德尔遗传数据库、治疗靶点数据库获得甲状腺结节相关靶点.将有效成分相关靶点与疾病靶点导入韦恩图网站进行在线分析,获得交集靶点,并利用STRING 数据库构建蛋白互作网络(protein-protein interaction networks,PPI)模型,利用Cytoscape 3.7.1 软件构建PPI 网络并筛选核心靶点.将药物及其活性成分、交集靶点及疾病导入Cytoscape 3.7.1 软件绘制成"药物-活性成分-交集靶点-疾病"网络图.利用Metascape 数据库对交集靶点进行基因本体(gene ontol-ogy,GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析.采用AutoDock 软件对关键靶点与活性成分进行分子对接.结果:浙贝母-夏枯草药对共15 个活性成分,171 个相关靶点.甲状腺结节疾病靶点1563 个.经韦恩图网站在线分析后得到浙贝母-夏枯草治疗甲状腺结节相关的靶点108 个.交集靶点PPI 网络分析得到AKT1、肿瘤蛋白P53(tumor protein P53,TP53)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)为核心靶点.GO 富集分析得到生物过程1 705 条、分子功能136 条、细胞组分115 条.KEGG 富集分析获得202 个信号通路.分子对接结果表明,浙贝母-夏枯草主要有效活性成分与靶点受体蛋白可以较好的结合.结论:浙贝母-夏枯草药对可通过多成分、多靶点、多通路治疗甲状腺结节.