基于网络药理学方法探讨地榆治疗结直肠癌的作用机制
Guangxi Medical Journal(2023)
摘要
目的 基于网络药理学方法探讨地榆治疗结直肠癌的作用机制.方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台获取地榆的有效活性成分及其作用靶点,利用药物靶标数据库、OMIM?、GeneCards?数据库获取结直肠癌的相关靶点.将地榆有效活性成分的作用靶点与结直肠癌的相关靶点取交集,获得共同靶点.将有效活性成分和共同靶点导入Cytoscape 3.7.2 软件构建"中药-成分-靶点-疾病"网络.针对共同靶点,使用STRING数据库和Cytoscape 3.7.2 软件构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,使用Metascape线上软件进行基因本体论(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果 共筛选出 9 个地榆有效活性成分,包括槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等.获得地榆有效活性成分的作用靶点 154 个和结直肠癌相关靶点1908 个,取交集后获得共同靶点94 个.PPI网络显示,地榆治疗结直肠癌的关键作用靶点包括肿瘤蛋白p53、苏氨酸蛋白激酶(AKT)1、Caspase-3、血管内皮生长因子A及肿瘤坏死因子等.GO功能富集分析结果显示,地榆治疗结直肠癌的作用靶点涉及的生物学过程主要有细胞群增殖的负调控、凋亡信号通路的调控、蛋白质磷酸化的正向调节等;涉及的细胞组分主要有细胞外基质、内质网腔、染色体区域等;涉及的分子功能主要有激酶结合、蛋白激酶活性、内肽酶活性、核受体活性等.KEGG通路富集分析结果显示,地榆治疗结直肠癌的作用靶点主要涉及癌症信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/AKT信号通路等.结论 地榆中的有效活性成分可能通过多个关键靶点来作用于膜筏、细胞外基质、内质网腔、染色体等细胞组分,实现蛋白质的磷酸化、细胞增殖及凋亡等分子功能,以及调节PI3K/AKT信号通路等,从而发挥治疗结直肠癌的作用.
更多关键词
Colorectal cancer,Radix sanguisorbae,Mechanism,Network pharmacology
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