大豆种质耐碱性状全基因组关联分析

TENG Weili,SHI Feifei,LIN Feng, LIU Chenxu,GAO Peng, ZHAO Huiyan,ZHAO Xue,HAN Yingpeng,LI Wenbin

Journal of Northeast Agricultural University（2023）

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摘要

以255份大豆种质为试验材料,利用混合碱模拟大庆市苏打盐碱地碱胁迫环境,在大豆种质芽期和苗期分别调查耐碱相关性状,结合BLINK和FarmCPU两种方法进行全基因组关联分析.结果表明,共检测到64个关联SNP位点,其中3:37513903、3:37490361、9:37033917等7个SNP位点相对稳定,可靠性较高;筛选到26个功能注释基因,根据功能注释和基因表达量,推测3个基因与耐碱相关,分别为Glyma.03G160200、Glyma.09G149900和Glyma.19G067400.

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关键词

soybean,alkali tolerance,germination stage,seedling stage,genome-wide association analysis

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