云南原始地方种四路糯基因组中的MITE类转座子"124"
Journal of Anhui Agricultural Sciences(2022)
Abstract
[目的]研究四路糯与普通玉米之间的亲缘关系.[方法]比较四路糯与B73基因组中"124"转座子的构成差异.[结果]在B73基因组中鉴定出13个"124"转座子序列和其插入位点信息;通过重测序得到约120 Gb的四路糯基因组序列,并从中鉴定出17个"124"转座子序列和其插入位点信息;在二者基因组中存在3个共同的"124"插入位点,这些位点展示出"124"转座子在序列和插入位点一致;B73基因组和四路糯基因组中均存在与waxy基因中"124"一致的转座子序列;建立的系统进化树可将"124"转座子归为4种类型,其中并没有单一基因组来源的类型.[结论]四路糯与B73基因组的差异是玉米种内的差异.
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