基于生物信息学的Prohibitin在乳腺癌中的表达及意义
Chinese Journal of Clinical Laboratory Science(2019)
摘要
目的 通过生物信息学高通量多组学数据库分析浸润性乳腺癌组织中prohibitin(PHB)的表达及其临床意义.方法 下载TCGA和METABRIC乳腺癌数据,应用多种工具比较癌组织和癌旁组织中PHB表达情况,并分析PHB表达与乳腺癌患者临床病理特征及预后之间的相关性,进行PHB蛋白互相作用预测及功能分析.结果 PHB在多种癌组织中较癌旁组织高表达,乳腺癌中PHB基因突变和表达量改变比例较高;PHB基因表达对于乳腺癌具有良好的诊断效能(P<0.01);PHB表达与乳腺癌患者ER受体、HER2、PAM50分型、肿瘤纯度等指标有关(P<0.05).生存分析表明,乳腺癌PHB高表达是影响乳腺癌的独立危险因素(P<0.01).HRAS、KSR1、ARAF与PHB相互作用且相关性较高,在乳腺癌组织中可见表达改变.结论 PHB在乳腺癌、卵巢癌等多种癌组织中表达升高,并且PHB高表达明显影响乳腺癌患者预后,PHB基因表达对乳腺癌的诊断效能较好,可作为乳腺癌诊断、预后的潜在标志物.
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