环状RNA0047905作用于AGS胃癌细胞株的蛋白表达谱分析

目的:筛选胃癌细胞中环状RNA(circRNA)0047905可能调控的下游分子蛋白。方法:AGS胃癌细胞株(购自中科院上海细胞库)干扰circRNA0047905的表达，应用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)蛋白质谱分析技术对AGS胃癌细胞株在干扰circRNA0047905表达前后，分为对照组和si-circRNA0047905干扰组，进行蛋白质谱分析检测，分析鉴定AGS胃癌细胞株在干扰circRNA0047905表达后差异表达的蛋白质；并借助生物信息学对差异表达的蛋白进行功能聚类分析。结果:实验研究共鉴定到3 664个蛋白，其中存在显著差异的蛋白数为173[circRNA0047905干扰组/对照组；差异倍数(FC)≥1.50或≤0.67进行相应的筛选]；对差异表达的蛋白进行功能通路分析，差异表达的蛋白主要参与了细胞能量代谢、核酸代谢、细胞周期、细胞骨架等众多细胞生物学功能调控。结论:干扰circRNA0047905表达后，AGS胃癌细胞可能通过p53信号通路发生了细胞凋亡和细胞周期阻滞。