G2型疫苗免疫压力下猪流行性腹泻病毒S1部分基因的遗传进化分析

为了研究G2型疫苗免疫后PEDV毒株的遗传进化特点,从广西某规模化猪场G2型疫苗免疫前后的3次PED疫情中采集110份临床样品进行检测,对得到的8株PEDV的S1部分基因进行了生物信息学分析.结果 显示,用G2型疫苗免疫后均能有效控制PEDV疫情,但不稳定;经测序表明该猪场流行的PEDV为G2-a-non S-INDEL型;同时,发现该猪场流行的PEDV病毒在第295位(Q295R)氨基酸处存在独特的分子特征,且在G2型疫苗使用后PEDV S1部分基因在信号肽区域、抗原表位区、N-糖基化位点等功能区有4处(T5P、S219N、V273L、I323 V)氨基酸位点发生了独特的突变.研究所发现的广西地区PEDV毒株在G2疫苗免疫压力下呈现新的分子特征,为PEDV N-糖基化位点病毒的抗原性以及PEDV免疫逃逸机制的研究提供了基础数据.