阿拉善马鹿冬季肠道菌群的多样性
Chinese Journal of Wildlife(2020)
Abstract
通过高通量测序技术,对采自贺兰山的20只阿拉善马鹿粪便进行测序及菌群多样性分析.结果表明,20个样品共获得1564112条序列,有效序列1399562条和2740个OTUs.其中样品包含24个门和283个属,在门水平上核心菌门,分别是厚壁菌门(Firmicutes)76.71%、拟杆菌门(Bacteroidetes)14.16%、变形菌门(Proteobacteria)3.51%.在属水平上,核心菌属有11个,占肠道菌群的31.46%,分别为孢子杆菌属(Sporobacter)7.38%、拟杆菌属(Bacteroides)4.15%、梭菌属系列(Clostridium IV、Clos-tridium XlV)3.63%、罗氏菌属(Roseburia)3.00%、胃瘤球菌(Ruminococcus)1.85%、奥氏杆菌(Oscillibacter)1.80%、Intestinimonas 1.56%、Akkermansia 1.50%、Alistipes 1.49%、Flavonifractor 1.47%.由此可知,阿拉善马鹿肠道菌群复杂多样,为进一步研究阿拉善马鹿肠道菌群功能提供理论依据.
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