东北狍PDGFA基因cDNA克隆及表达分析

为了研究血小板衍生生长因子A(PDGFA)基因在狍茸生长发育中的调控作用,试验采用分子克隆技术得到PDGFA基因全部编码区的cDNA序列并结合生物信息学方法进行分析.结果表明:获得的东北狍PDGFA基因cDNA长度为653 bp,其中包括594 bp的开放阅读框(ORF),编码197个氨基酸.PDGFA基因编码蛋白为不稳定蛋白,相对分子质量为22 259.65,等电点为8.53,具备信号肽,属于分泌性蛋白.蛋白质二级结构由α-螺旋、扩展链及无规则卷曲结构组成.通过构建系统进化树发现,狍与白尾鹿亲缘关系最近,与野牦牛、水牛、野猪、绵羊的亲缘关系较近,与原鸡、人、褐家鼠、斑马鱼的亲缘关系较远.实时荧光定量PCR分析显示,PDGFA基因在狍茸顶端组织不同组织层表达存在差异,其中前软骨层和软骨层的相对表达量显著高于皮肤层和间充质层(P＜0.05).