青岛地区2012—2014年甲型H1N1流感病毒基因特征
Chinese Journal of Public Health（2016）
摘要
目的了解2012—2014年山东省青岛地区人群甲型H1N1流行性感冒（流感）病毒流行株基因特征及变异趋势。方法收集2012年4月—2014年3月青岛地区流感样病例咽试子2 100份,分离鉴定136株,随机抽取51株,应用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）扩增血凝素（HA）、神经氨酸酶（NA）、基质蛋白（MP）3个基因片段全长,并进行序列测定,对各基因片段进行系统发育分析及基因和氨基酸位点变异分析。结果 HA、NA进化树分析发现,2012—2014年青岛地区流行的甲型H1N1流感病毒分为3个分支;HA蛋白的氨基酸位点分析显示,部分毒株在抗原决定位点,受体结合位点以及其他位点上发生一定程度的变异,涉及15个氨基酸位点变化;NA蛋白的氨基酸位点分析显示,与疫苗株比较有10处氨基酸位点发生了明显变异;M2蛋白分析显示所有毒株均对金刚烷胺类药物耐药。结论 2012—2014年青岛地区流行的甲型H1N1流感病毒在抗原和受体结合位点均发生基因变异及抗药毒株的出现对流感防控提出更大的挑战。
更多关键词
influenza A H1N1 virus,hemagglutinin gene,neuraminidase gene,phylogenetic analysis
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