高杆野生稻PR2同源序列的分离与序列分析
Journal of Wuhan Botanical Research(2009)
Abstract
根据已知植物病程相关蛋白基因β-1,3-葡聚糖酶基因(PR2)的保守结构域设计2对简并引物,从高杆野生稻基因组DNA中分离出3条防卫基因类似物(defense-genes analogues,DGAs),其中2条具有通读的ORF,另一条提前出现终止密码子。对这3条序列在NCB I上进行同源性搜索发现,在核苷酸水平这3条序列均与水稻的β-1,3-葡聚糖酶基因具有90%~93%的同源性,与已知大麦、小麦、高梁、黑麦、燕麦、玉米等其它植物的β-1,3-葡聚糖酶基因具有69%~81%的同源性。在氨基酸水平与水稻、大麦、小麦、黑麦的-β1,3-葡聚糖酶具有60%~93%的同源性。对具有通读ORF的2条序列RD1-GG6和RD1-GG12进行表达分析,发现经水杨酸(SA)诱导后表达量明显提高。
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Key words
3-glucanase,β-1,defense-gene analogue(dga),oryza alta,enzymes,genomics,gene expression,genes,open reading frames,dna cloning
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