烟草MITE位点间多态性（IMP）标记开发及其遗传作图应用

为在烟草（Nicotiana tabacum）上进行IMP（inter-MITE polymorphism,MITE位点间多态性）标记开发,利用美国烟草基因组测序数据和MITE（miniature inverted repeat transposable element,微型反向重复转座元件）结构特征,通过生物信息学方法获得11 581组具有特异TIR（terminal inverted repeat,末端重复元件）序列的MITE及其多序列联配结果,并根据联配结果设计219条烟草IMP引物;利用9个不同类型烟草代表性品种进行测试,其中119条引物PCR扩增成功,引物开发成功率为54.6%;进一步对一个烤烟遗传群体亲本‘红花大金元’和‘HicksBroadleaf’进行标记筛选,共获得29个多态性标记,群体检测表明有21个标记可以整合定位到一个SSR标记遗传连锁图上.说明IMP标记在烟草中是一种可以利用的分子标记,但跟其他标记一样表现出较低的多态性,需高通量检测平台与之配套来提高其开发效率.