骨质疏松诊断标志物的筛选及其与免疫浸润的关系

JI Chao, CHEN Yixiao, LIU Kai,SU Xiaochen, TENG Menghao, GUO Yan, JI Wenchen,LI Meng

Journal of Clinical Medicine in Practice(2023)

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摘要
目的 寻找潜在的骨质疏松(OP)诊断标志物,并分析免疫浸润在OP发展中的作用.方法 使用源自基因表达综合数据库(GEO)的基因表达谱数据集来鉴定OP的差异表达基因(DEGs),并通过富集分析揭示DEGs的潜在机制;采用最小绝对值收敛和选择算法(LASSO)逻辑回归分析和支持向量机递归特征剔除算法(SVM-RFE)筛选和验证OP的诊断标志物;使用CIBERSORT评价OP组织中免疫细胞的浸润情况,分析诊断标志物与免疫细胞浸润的相关性.结果 本研究共筛选出5个诊断相关基因为关键基因:SKAP2、SLC30A3、TDRD12、RPL10 和 CSPP1.SKAP2、SLC30A3、TDRD12、RPL10 和 CSPP1 被确定为OP的诊断标志物.SKAP2、SLC30A3、TDRD12、RPL1O联合CSPP1诊断OP的效能较高.22种免疫细胞的相关热图显示,活化的肥大细胞与浆细胞呈正相关,静息肥大细胞与嗜酸性粒细胞呈正相关.此外,活化的CD4记忆T细胞与调节性T细胞呈负相关,巨噬细胞与记忆B细胞呈负相关.结论 免疫细胞浸润在OP的发生和发展中至关重要,静息CD4记忆T细胞和M2巨噬细胞可能参与了 OP的发病机制,这些结果有助于为OP的诊断和治疗提供新的思路.
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关键词
osteoporosis,bioinformatics,immune infiltration,diagnostic markers,immune cell,key gene
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