紫外线照射后人晶状体上皮细胞的iTRAQ定量蛋白质组学研究

目的:探索氧化损伤状态下人晶状体上皮细胞(SRA01/04)的蛋白表达变化,以期为年龄相关性白内障(ARC)发病机制的研究提供新的蛋白靶点.方法:将SRA01/04 细胞分为实验组和对照组,实验组即细胞通过紫外线(UVB)照射以构建细胞氧化损伤模型,照射时长为 10min;对照组即细胞未经任何处理.应用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术对这两组细胞进行蛋白组测序,以差异倍数>1.2 且p<0.05 的标准筛选差异表达蛋白(DEPs),并通过基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)数据库分别对上调和下调显著性前 50 的 DEPs 进行功能富集分析,利用 Pathway commons构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络.结果:本研究共筛选出552 个DEPs.相比于对照组,实验组中上调的DEPs有 176 个,包括HMGB1、USP1 等,下调的 DEPs 有 376 个,包括 POLR2A、POLR2B 等.GO 和KEGG富集分析显示上调和下调显著性前 50 的DEPs参与了多种重要的生物学过程和信号通路.PPI网络提示氧化损伤修复(ODR)相关蛋白在UVB诱导的氧化损伤中可能起关键作用.结论:UVB 照射 SRA01/04 细胞可致多种蛋白,尤其是ODR相关蛋白的表达发生改变,这些研究结果为深入探索ARC发病机制以及研究与治疗靶点相关的蛋白质或通路提供了细胞层面的参考.