高粱磷脂酶D基因家族的鉴定和表达分析

ZHANG Zheng,Lü Yang,HAN Shaopeng, LI Sen, LUO Xiaotian, LIU Limin,ZENG Gongjian, GAO Xinqiang,HU Yongfeng,SHEN Xiangling

Amino Acids and Biotic Resources（2022）

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摘要

磷脂酶D(PLD)是植物生长和胁迫反应过程中参与膜磷脂分解代谢的关键酶.PLD编码基因在高等植物中构成了一个大的基因家族,但是仍未对高粱PLD基因家族进行深入研究.本研究中,通过全基因组分析,鉴定了 15个PLD基因,并分成6个亚组,初步揭示了 SbPLDs的基因结构、保守结构域、染色体定位和系统发育关系等信息.基因复制的研究表明,片段复制在高粱PLD基因家族的扩展中发挥了重要作用,SbPLDs在进化过程中经历了强烈的纯化选择.此外,转录组数据表明,受启动子区上游顺式元件调控的PLD家族基因可能在高粱的生长发育中发挥重要作用.通过real-time PCR分析,显示部分SbPLDs参与非生物胁迫和激素途径的潜力.亚细胞定位表明,高粱PLD蛋白在细胞质中富集,可能具有抗逆胁迫的功能.本研究为了解高粱PLD基因的特征提供了理论参考,为研究高粱PLD基因家族的进化提供了新的视角,也为阐明高粱PLD基因家族的功能提供了基础信息.

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