疟原虫棒状复合体红细胞结合受体基因筛选与生物信息学分析

目的 利用生物信息学预测RhopH complex相应红细胞受体的候选基因,为防治疟疾提供依据.方法 对小鼠11号染色体D11Mit10和D11Mit284区间表达的基因进行红细胞转录、信号肽、跨膜区以及GPI结构评估.结果 小鼠11号染色体D11Mit10和D11Mit284区间表达的基因共339个,通过红细胞蛋白组学数据库筛选出137个在红细胞表达的基因,进一步分析137个红细胞蛋白组基因发现拥有跨膜区的7个,具有信号肽的4个,但均不具有GPI位点.Atp5g1、Slc4a1、Itgb3等基因可能表达在红细胞膜表面,具有成为棒状体蛋白结合受体的可能.结论 利用NCBI、Uniprot、ExPASy-PortParam等网络资源评估以Slc4a1和Itgb3为代表的基因可能为RhopH complex与红细胞结合的受体基因.