前列腺癌差异表达基因的分析及其miRNA和lncRNA的预测

目的:筛选前列腺癌的差异表达基因及其上下游的调控分子.方法:通过TCGA数据库和GEO数据库,经RSudio软件分析得到差异基因(DEGenes);采用STRING工具构建差异基因的相互作用网络、CYTO-SCAPE软件筛选核心模块,并对差异基因进行GO和KEGG分析,运用mirDIP数据库预测核心基因的miRNA,登录STARBASE对miRNA进行生存分析并预测其lncRNA.结果:筛选出前列腺癌的差异表达基因共137个,GO分析结果显示有23个富集结果,KEGG分析有20个通路被富集;对7个核心差异基因进行分析,预测出2个与总体生存率相关的miRNA,这些miRNA有4个对应的lncRNA;最后构建lncRNA-mRNA互作网络.结论:从生物信息学角度对前列腺癌的差异基因进行筛选和分析,筛选出前列腺癌发生过程中的关键基因及其上下游的调控分子.