栗疫菌CpIAP基因生物信息学分析及功能研究

Journal of Nanjing Agricultural University(2011)

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摘要
寻找栗疫菌的凋亡抑制蛋白(inhibitor of apoptosis proteins,IAPs)类蛋白,明确该蛋白与其他物种IAPs的进化关系,并对CpIAP基因功能进行初步研究。以IAPs家族的典型结构域"BIR"为靶标,对栗疫菌基因组数据库进行BLAST搜索。运用生物信息学对预测的CpIAP蛋白结构进行分析并构建系统进化树;采用同源重组的策略,构建CpIAP基因缺失突变体,并重新导入该基因全长片段获得互补株。结果从栗疫菌中鉴定了1个IAP基因,Southern blot验证为单拷贝。生物信息学分析表明:CpIAP基因全长2 997 bp,编码920个氨基酸,具有2个BIR结构域;进化关系上CpIAP与人Survivin和酵母IAP较近。CpIAP敲除突变体命名为ΔIAP,ΔIAP菌落形态改变,生长速率减慢,致病力下降,丧失产孢能力。上述结果表明:CpIAP参与了栗疫菌的菌落形态建成、分生孢子形成和致病过程。
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关键词
Cryphonectria parasitica,virulence,inhibitor of apoptosis proteins(IAPs),conidation
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