目前研究方向为微生物计算、比较、进化及功能基因组学。担任国际SCI刊物Scientific Reports(Nature出版社）编委会成员。担任国际SCI刊物Current Genomics和Current Bioinformatics客座编辑。不定期担任Nucleic Acids Research、Bioinformatics、Biochimie、Microbiology(SGM)、BMC Microbiology、Current Genomics、Current Bioinformatics、Journal of Theoretical Biology、Neurocomputing, Journal of Biomolecular Structure and Dynamics、BioSystems、International Journal of Endocrinology、Computational and Mathematical Methods in Medicine等20种国外期刊的通讯审稿人。